Đi đôi với chất lượng kết quả học tập, công tác xây dựng nề nếp cho học sinh là một trong những nhiệm vụ trọng yếu hàng đầu của trường THCS Ngũ Hiệp. Thực tế, nếu học sinh không có nề nếp thì việc giáo dục và dạy học trên lớp sẽ không đạt hiệu quả cao. Tổ chức Đội đóng vai trò quan trọng trong việc quản lý nề nếp, giáo dục ý thức học sinh. Thật vậy, Đội phụ trách chung nề nếp học sinh toàn trường, quản lý nề nếp học sinh thông qua đội ngũ sao đỏ và duy trì nề nếp của học sinh toàn trường trong các buổi học. Ban chỉ huy Liên đội kết hợp với đội sao đỏ của Liên đội theo dõi, đôn đốc đội viên thực hiện một cách nghiêm túc và tự giác các nề nếp hàng ngày như: 15’ đầu giờ, vệ sinh trực nhật, chăm sóc tốt các công trình măng non, thể dục giữa giờ ...
Hỗ trợ tổ chức Đội quản lý nề nếp học sinh có một phần đóng góp không nhỏ của các giáo viên chi đoàn trường THCS Ngũ Hiệp. Thật vậy, không chỉ tích cực trong các hoạt động chuyên môn mà các đoàn viên Chi đoàn trường THCS Ngũ Hiệp còn là lực lượng nòng cốt trong việc hỗ trợ công tác Đội giáo dục ý thức học sinh nhất là trong giờ truy bài. Xác định vai trò quan trọng của hoạt động này trong việc tạo điều kiện cho học sinh chuẩn bị tốt bài học, có tâm thế tốt bước vào buổi học nên các giáo viên trong Chi đoàn thường xuyên lên lớp đầu giờ để nhắc nhở uốn nắn học sinh về tư thế ngồi, việc sắp xếp bàn ghế có thẳng hàng không, lớp học đã sạch sẽ chưa, tổ chức cho các tổ trưởng kiểm tra sự chuẩn bị ở nhà của từng thành viên về đồ dùng học tập, sách giáo khoa, vở ghi… giúp cho giờ truy bài đạt hiệu quả cao.
Đặc biệt trong thời gian học sinh trở lại trường sau khi nghỉ vì dịch Covid 19, Chi đoàn đóng vai trò quan trọng trong việc nhắc nhở học sinh thực hiện nghiêm túc các biện pháp phòng chống dịch. Chi đoàn đã phân công các giáo viên đứng ngoài cổng trường để đo thân nhiệt cũng như đeo đầy đủ khẩu trang khi vào lớp; hướng dẫn, nhắc nhở việc vệ sinh lớp học, vệ sinh cá nhân của học sinh như quét dọn lớp, lau chùi bàn ghế, rửa tay trước khi vào lớp, cuối giờ ra chơi, trước giờ ăn - ngủ...